Stefanie Werder studierte an der Universität Bern Sozialanthropologie mit Fokus auf Migration und Bildung. Im Rahmen ihrer Bachelorarbeit untersuchte sie die Bildungsmöglichkeiten von syrischen Flüchtlingskindern in Ankara, im Master widmete sie sich den Bildungswegen von unbegleiteten, minderjährigen Asylsuchenden und Flüchtlingen (MNA) in der Schweiz. Während dem Studium arbeitete sie bei einem internationalen Kinderhilfswerk und war zusätzlich als Hilfswerksvertreterin an Asylanhörungen des Staatsekretariats für Migration tätig.
Nach Abschluss ihres Studiums übernahm sie die Koordination der Anschlusslösungen für MNA in einem MNA-Wohnheim der AOZ. Dort begleitete sie die Jugendlichen bei der Berufswahl sowie der Lehrstellensuche und war für das Erschliessen geeigneter Bildungsangebote zuständig.
Stefanie Werder arbeitet seit August 2019 bei der Stiftung Futuri. Sie unterstützt als Job Coach Jugendliche und Erwachsene beim Berufseinstieg.